Quelle est la meilleure méthode ?
—Tests pour le diagnostic de l'infection par le SRAS-CoV-2
Pour les cas confirmés de COVID-19, les symptômes cliniques courants signalés comprennent la fièvre, la toux, la myalgie ou la fatigue.Pourtant, ces symptômes ne sont pas des caractéristiques uniques du COVID-19 car ils sont similaires à ceux d'autres maladies infectées par un virus telles que la grippe.Actuellement, la PCR en temps réel des acides nucléiques du virus (rt-PCR), l'imagerie CT et certains paramètres hématologiques sont les principaux outils de diagnostic clinique de l'infection.De nombreux kits de test de laboratoire ont été développés et utilisés pour tester des échantillons de patients pour le COVID-19 par le CDC chinois1, CDC américain2et d'autres entreprises privées.Le test d'anticorps IgG/IgM, une méthode de test sérologique, a également été ajouté comme critère de diagnostic dans la version chinoise mise à jour des directives de diagnostic et de traitement pour la nouvelle maladie à coronavirus (COVID-19), qui a été publiée le 3 mars.1.Le test rt-PCR d'acide nucléique viral est toujours la méthode de diagnostic standard actuelle pour le diagnostic de COVID-19.
StrongStep®Novel Coronavlrus (SARS-COV-2) Multiplex Real-Time PCR Kit (détection de trois gènes)
Pourtant, ces kits de test PCR en temps réel, à la recherche de matériel génétique du virus, par exemple dans des prélèvements nasaux, oraux ou anaux, souffrent de nombreuses limitations :
1) Ces tests ont des délais d'exécution longs et sont compliqués à mettre en œuvre ;ils prennent généralement en moyenne plus de 2 à 3 heures pour générer des résultats.
2) Les tests PCR nécessitent des laboratoires certifiés, des équipements coûteux et des techniciens formés pour fonctionner.
3) Il existe un certain nombre de faux négatifs pour la rt-PCR de COVID-19.Cela peut être dû à une faible charge virale du SRAS-CoV-2 dans l'échantillon d'écouvillon des voies respiratoires supérieures (le nouveau coronavirus infecte principalement les voies respiratoires inférieures, telles que les alvéoles pulmonaires) et le test ne peut pas identifier les personnes qui ont subi une infection, se sont rétablies et éliminé le virus de leur corps.
Recherche par Lirong Zou et al4ont constaté que des charges virales plus élevées étaient détectées peu après l'apparition des symptômes, avec des charges virales plus élevées détectées dans le nez que dans la gorge et le schéma d'excrétion d'acide nucléique viral des patients infectés par le SRAS-CoV-2 ressemble à celui des patients atteints de grippe4et semble différent de celui observé chez les patients infectés par le SRAS-CoV-2.
Yang Pan et al5a examiné des échantillons en série (écouvillons de gorge, crachats, urine et selles) de deux patients à Pékin et a constaté que les charges virales dans les échantillons de prélèvement de gorge et d'expectorations atteignaient un pic environ 5 à 6 jours après l'apparition des symptômes, les échantillons d'expectorations montraient généralement des charges virales plus élevées que prélèvements de gorge.Aucun ARN viral n'a été détecté dans les échantillons d'urine ou de selles de ces deux patients.
Le test PCR ne donne un résultat positif que lorsque le virus est encore présent.Les tests ne peuvent pas identifier les personnes qui ont subi une infection, récupéré et éliminé le virus de leur corps.En réalité, seuls 30 à 50 % environ étaient positifs pour la PCR chez les patients atteints d'une nouvelle pneumonie à coronavirus diagnostiquée cliniquement.De nombreux nouveaux patients atteints de pneumonie à coronavirus ne peuvent pas être diagnostiqués en raison d'un test d'acide nucléique négatif, ils ne peuvent donc pas obtenir le traitement correspondant à temps.De la première à la sixième édition des lignes directrices, reposant uniquement sur le diagnostic des résultats des tests d'acide nucléique, ce qui a causé de gros problèmes aux cliniciens. Hôpital, est mort.Au cours de sa vie, il a subi trois tests d'acide nucléique en cas de fièvre et de toux, et la dernière fois, il a obtenu des résultats positifs à la PCR.
Après discussion par des experts, il a été décidé d'augmenter les méthodes de test sérique comme nouveau critère de diagnostic.Alors que les tests d'anticorps, également appelés tests sérologiques, peuvent confirmer si une personne a été infectée même après que son système immunitaire a éliminé le virus qui cause le COVID-19.
Test rapide d'anticorps StrongStep® SARS-COV-2 IgG/IgM
Le test d'anticorps IgG/IgM aidera à retracer d'une manière beaucoup plus basée sur la population qui a eu l'infection, car de nombreux cas semblent se propager à partir de patients asymptomatiques qui ne peuvent pas être identifiés facilement.Un couple à Singapour, le mari a été testé positif par PCR, le résultat du test PCR de sa femme était négatif, mais les résultats des tests d'anticorps ont montré qu'elle avait des anticorps, tout comme son mari.
Les tests sérologiques doivent être soigneusement validés pour s'assurer qu'ils réagissent de manière fiable, mais uniquement aux anticorps dirigés contre le nouveau virus.Une préoccupation était que la similitude entre les virus qui causent le syndrome respiratoire aigu sévère et le COVID-19 pourrait entraîner une réactivité croisée.L'IgG-IgM développé par Xue Feng wang6a été considéré comme pouvant être utilisé comme test au point de service (POCT), car il peut être effectué près du chevet avec du sang prélevé au doigt.Le kit a une sensibilité de 88,66 % et une spécificité de 90,63 %.Cependant, il y avait encore des faux positifs et des faux négatifs.
Dans la version chinoise mise à jour des directives de diagnostic et de traitement de la nouvelle maladie à coronavirus (COVID-19)1, les cas confirmés sont définis comme des cas suspects qui répondent à l'un des critères suivants :
(1) Des échantillons des voies respiratoires, des échantillons de sang ou de selles ont été testés positifs pour l'acide nucléique du SRAS-CoV-2 à l'aide de la rt-PCR ;
(2) Le séquençage génétique du virus à partir d'échantillons d'échantillons des voies respiratoires, de sang ou de selles est hautement homologue avec le SARS-CoV-2 connu ;
(3) Les anticorps IgM et IgG spécifiques du nouveau coronavirus sérique étaient positifs ;
(4) L'anticorps IgG spécifique au nouveau coronavirus sérique est passé de négatif à positif ou l'anticorps IgG spécifique au coronavirus pendant la période de récupération est 4 fois plus élevé que pendant la période aiguë.
Diagnostic et traitement du COVID-19
| Des lignes directrices | Publié | Critères diagnostiques confirmés |
| version 7 | 3mars.2020 | ❶ PCR ❷ NGS ❸ IgM+IgG |
| version 6 | 18 février 2020 | ❶ PCR ❷ NGS |
Référence
1. Lignes directrices pour le diagnostic et le traitement de la pneumonie à nouveau coronavirus (version d'essai 7, Commission nationale de la santé de la République populaire de Chine, publiée le 3 mars 2020)
http://www.nhc.gov.cn/yzygj/s7652m/202003/a31191442e29474b98bfed5579d5af95.shtml
2. La recherche utilise uniquement le protocole RT-PCR en temps réel pour l'identification du 2019-nCoV
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/rt-pcr-detection-instructions.html
3. Singapour revendique la première utilisation d'un test d'anticorps pour suivre les infections à coronavirus
https://www.sciencemag.org/news/2020/02/singapore-claims-first-use-antibody-test-track-coronavirus-infections
4. Charge virale du SRAS-CoV-2 dans les échantillons des voies respiratoires supérieures des patients infectés 19 février 2020 DOI : 10.1056/NEJMc2001737
5. Charges virales de SRAS-CoV-2 dans des échantillons cliniques Lancet Infect Dis 2020 publié en ligne le 24 février 2020 (https://doi.org/10.1016/S1473-3099(20)30113-4)
6. Développement et application clinique d'un test rapide d'anticorps combinés IgM-IgG pour le SRAS-CoV-2
Diagnostic d'infection XueFeng Wang ID ORCID : 0000-0001-8854-275X
Heure de publication : 17 mars 2020
